我们正在评估一名患有神经发育障碍的儿童,我们怀疑其存在遗传原因,因为他提供了这方面的提示性数据(例如,多种相关的先天畸形)。我们做了一个 心脑血管病 事实证明这是正常的。我们还开展了 临床外显子组(脑髓瘤) 尚未向我们提供决定性信息。我们从哪里继续?

重新评估不确定含义的变体。
查看基因研究附录以获取相关信息。

遗传学家可能已经鉴定出致病性变异 隐性基因,这与您的临床怀疑相符,但由于未发现第二个致病变异,因此正文中尚未报告。如果表型与临床怀疑一致,您可能需要进一步调查:

确保其他等位基因上不存在不确定意义的变异。

为了证实这一点,有必要对父母双方进行同隔离研究。如果这两种变异都在反式中被发现,你的可疑诊断就会得到加强。

检查生物标志物的存在。

如果常染色体隐性基因有 生物标志物 进行有针对性的研究(酶学、生化)可能是一种有效的策略,如果检测到异常,则进行更复杂的诊断测试(RNA 测序)以寻找深层内含子突变。

考虑对受影响的基因进行 MLPA 的可能性。

可以组合几种突变机制(复合杂合性),请记住 小尺寸缺失 它们可能在两项测试(外显子组和 aCGH)中都未被检测到。

https://bmcmedgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12920-021-01053-3

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3759716/

检查是否是测序无法诊断的疾病。

有一些 外显子组测序无法诊断的遗传病 以目前可用的技术。如果表型与其中任何一个兼容,则可能需要请求特定的诊断测试。

不时重新评估表型以寻找新的指导症状。

你可以尝试 完善您的表型描述 使用 HPO 代码。通过这种方式,您将有助于遗传学家应用计算机过滤器来重新分析数据。

通过 HPO 代码进行表型描述,您可以使用计算机鉴别诊断工具,例如 芬诺米泽尔.

如果您的遗传学家没有自动分析原始测序数据,请要求他们在 2-5 年后重新分析。

有多个科学出版物表明,通过在完成后 12-24 个月重新分析测序数据,诊断盈利能力提高了 10-15%。这是科学知识快速积累的结果:

  • 新致病基因的发现。
  • 澄清先前未涉及疾病的变异体的致病性。
  • 参考基因组中群体变异的细化(基因组参考联盟).
  • 在其他家庭中进行的同隔离研究。
  • 过滤器在生物信息数据处理中应用的技术改进(例如,从测序数据进行CNV研究)。
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc1812033
考虑进行三外显子组测序(研究)的可能性。

三外显子组测序 (索引案例,父亲,母亲)允许交叉亲属的数据,以应用过滤器消除已遗传的罕见遗传变异,寻找尚未完全研究的基因中的从头变异,这些变异可能是解释表型的候选者。当它在研究项目中系统应用时,这种技术就会发挥出最大的潜力,因为它使我们能够发现与疾病有关的新基因,并通过实验技术证明它们的致病性。

与其他专业人士一起开始网络调查。

未确诊疾病网络 是一个针对未经诊断的疾病的研究网络,来自多个国家的专业人员参与其中,并充当罕见疾病研究的促进者。有一个西班牙总部依赖于ISCIII,它被称为 西班牙UDP.

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