什么是假基因?

假基因是一种非功能性 DNA 序列,与功能性基因非常相似,但不产生功能性蛋白质产物。假基因被认为是进化遗物,通常源自曾经具有功能但随着时间的推移积累了突变的基因,使得它们无法产生功能性蛋白质。

假基因主要有两种类型:

  1. 处理后的假基因: 这些假基因源自加工后的信使 RNA 分子的逆转录和整合到基因组中。当功能基因的信使 RNA 通过逆转录转座子(一种可以在基因组内移动的遗传元件)逆转录回 DNA 时,通常会发生这种情况。所得的 DNA 序列被整合到基因组中,但通常缺乏内含子和调控元件,使其失去功能。
  2. 未处理的假基因: 这些假基因通常是由基因复制事件引起的。当基因复制时,随着时间的推移,一个拷贝会积累突变,从而失去产生功能性蛋白质的能力。这些突变可能涉及编码区的破坏、过早终止密码子的引入或影响调节区的删除。

假基因曾经被认为是没有生物学意义的“垃圾DNA”。然而,最近的研究表明,一些假基因可能仍然在各种细胞过程中发挥作用。例如,它们可以作为生成小调控RNA的模板或参与附近基因的调控。然而,大多数假基因是无功能的,对蛋白质生产没有贡献。

假基因的临床后果。

假基因的临床后果可能会有所不同,并且高度依赖于所涉及的假基因的具体背景和功能。尽管大多数假基因没有直接的临床影响,但有些可能与某些疾病或病症有关。以下是假基因可能产生临床后果的一些方式:

  1. 干扰基因测试: 在某些情况下,假基因可能与功能基因非常相似,并且可能干扰旨在检测特定基因突变的基因测试。这个问题在基于鸟枪测序的大规模测序测试中尤为重要,因为DNA片段化意味着基因及其同源假基因的序列可能会被混淆。
  2. 对基因表达的影响: 一些假基因可以充当其相关功能基因的分子“竞争者”。这意味着它们可能会干扰正常的功能基因表达,从而影响基因调控并导致癌症等疾病。
  3. 基因调控: 一些假基因可能通过产生与其他基因相互作用的非编码RNA而在基因调控中发挥作用。这可能会影响相关基因的表达水平并对疾病产生影响。
  4. 在疾病中的作用: 有时,特定的假基因可能与特定的疾病或病症有关。例如,已发现一些假基因与耐药性或神经系统疾病有关。
  5. 治疗潜力: 一些假基因可能具有潜在的治疗应用。
由假基因引起的神经遗传性疾病。

基因转换是功能基因的DNA序列被相关假基因的序列替换或修饰的过程。这种现象可能会产生重大后果,在某些情况下可能与遗传疾病有关。以下是假基因基因转换如何导致疾病的总结:

  1. 同系物和重组: 假基因通常与其相关功能基因具有序列相似性。由于这种相似性,功能基因序列和假基因序列之间可能发生重组过程。重组是 DNA 片段在不同 DNA 分子之间交换、创建新的组合序列的过程。
  2. 序列交换: 在重组过程中,假基因序列的片段可以并入功能基因中,反之亦然。如果假基因的一部分插入到功能基因中,这可能会破坏基因序列,影响其编码功能蛋白质的能力。另一方面,如果将功能基因的一部分插入到假基因中,则假基因可以获得使其与功能基因更相似的特征。
  3. 对表达和功能的影响: 如果重组干扰功能基因的编码结构,则可能导致产生有缺陷或无功能的蛋白质。这可能对该基因调节的细胞功能或代谢途径产生直接影响。在更极端的情况下,重组甚至可能使功能基因完全失活。
  4. 相关疾病: 由假基因基因转换引起的疾病通常是由于必需基因功能丧失造成的。根据受影响基因的功能,这可能会导致多种疾病。例如,如果负责产生关键酶的基因因基因转换而失活,则可能导致代谢紊乱。
  5. 实践中的例子: 科学文献中有一些由假基因的基因转换引起疾病的例子。
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1.
Pasumarthi D、Dalal A. 假基因:对疾病和诊断的影响。 2019;12(3):4。
SMN1 和 SMN2 的示例。

SMN1(运动神经元存活 1)和 SMN2(运动神经元存活 2)基因与一种称为脊髓性肌萎缩症 (SMA) 的严重神经肌肉遗传病有关。 SMN1 和 SMN2 这两个基因都编码相同的必需蛋白质,称为 SMN(运动神经元生存),它在运动神经元的维护和功能中发挥着重要作用。大多数 SMA 病例是由 SMN1 基因丢失或缺失引起的。这种损失导致 SMN 蛋白严重不足,导致运动神经元退化,最终导致肌肉无力和该疾病的其他特征症状。

虽然SMN2与SMN1非常相似,但其中一个DNA碱基发生了变化。 SMN2产生的蛋白质的功能不如SMN1产生的蛋白质(它不会成为假基因,因为它保留了一些功能,但几乎),正因为如此,它不能保证运动神经元在SMN1缺失的情况下存活。然而,它确实在该疾病中发挥着作用,因为 SMN2 产生的 SMN 蛋白的功能量会影响 SMA 的严重程度。 SMN2 拷贝数较多的个体通常患有较轻的疾病,因为 SMN2 产生的 SMN 蛋白可以部分补偿 SMN1 的缺陷。

治疗方法: 由于 SMN2 在 SMA 的严重程度中发挥着调节作用,因此这种疾病的治疗通常侧重于增加 SMN2 产生的 SMN 蛋白的量。