Как построить нейропедиатрическую лабораторию.
С чего мне начать? Инструменты, которые сделают вашу жизнь проще.
- ИИ и детская неврология.
- Управление Docker и контейнерами.
- WordPress.
Знаете ли вы свои методы диагностики?
- Прогнозирование результатов массового секвенирования. ПредВЭС.
- Анализ покрытия геномики.
Используемые общедоступные базы данных.
Мы можем анализировать механизмы нейропедиатрических заболеваний на разных биологических уровнях. Для некоторых заболеваний характерно участие одного из них, а для других - рецидивирующее участие в нескольких. Однако группирование их в функциональные группы полезно для анализа их общих элементов и содействия их пониманию с биологической точки зрения.

Пиковый уровень.
Физические науки.
Биофизика.
Биостатистика.
Нано уровень.
Существуют различия между геномикой и генетикой.
- Генетика — это изучение функции и состава генов, а также их наследственности и заболеваний, которые они вызывают.
- Геномика — это исследование полного набора генетической информации организма, включая некодирующие области.
Геном человека упакован в хромосомы, состоящие из хроматина, который, в свою очередь, состоит из нитей ДНК, упакованных вокруг гистонов. Цепи ДНК образуются путем объединения пар оснований.

Мы можем классифицировать различные геномные заболевания на:
И генетические заболевания в:
- Точечные мутации и моногенетические заболевания.
- Динамические мутации и STR.
- Нарушения репарации ДНК.
- Теломеры.
Существует множество ресурсов для консультации по геномным и генетическим заболеваниям, например:

Есть два процесса, связанных с РНК, которые позволяют передавать генетическую информацию для производства белков. Они являются транскрипция и перевод, среди которых существуют различные процессы, в которых мРНК созревает из пре-мРНК, известные как механизмы посттранскрипционной модификации. В процессе участвуют несколько молекул на основе РНК, таких как т-РНК и мяРНК (рибонуклеопротеины). Существуют также механизмы модификации. постперевод белков.
- Транскрипция.
- Транскриптопатии.
- Пост-транскрипция.
- Перевод.
- Рибосомопатии.
- Пост-перевод.
Las протеинопатии Это все те генетические заболевания, которые поражают кодирующие области ДНК и влияют на конформацию аминокислотных цепей. Из этой концепции исключены, например, заболевания, вызванные некодирующей РНК или мутациями, которые затрагивают последовательность аминокислот.
Однако в этой главе мы собираемся сгруппировать заболевания в зависимости от типа белка, на который они влияют.
Существует 3 основные группы белков.
- Функциональные белки (ферменты). Его изменение приводит к метаболическим заболеваниям (метаболопатиям). Обычно они имеют аутосомно-рецессивное наследование. (хотя и не все).
- Структурные белки. Ее изменение приводит к микроскопическим (в клетке и тканях) или макроскопическим физическим (фенотипическим) изменениям. Обычно они имеют аутосомно-доминантное наследование.
- Передача сигналов в клетках и связывание лигандов. Это структурные белки со специфической функцией, связанные с внеклеточными и внутриклеточными путями связи. Существуют рецепторы, каналы и транспортеры, а также нейротрансмиттеры, гормоны и сигнальные каскады. Особенно они важны для центральной нервной системы, имеющей специфическую систему межклеточной связи (синапс).
В сети протеинатлас Гистологическую экспрессию различных белков можно оценить в зависимости от исследуемой ткани.
Большинство наследственных метаболических заболеваний (врожденные нарушения метаболизма) возникают из-за мутации фермента, который вызывает метаболический блок в безальтернативном метаболическом пути (хотя некоторые другие возникают, например, из-за транспортных патий). См. ниже метаболом.

За пределами классические нейромедиаторные заболеванияВ последние годы были обнаружены и другие сложные заболевания, связанные со специфическим механизмом синапса, которые в зависимости от их расположения в этой структуре можно классифицировать на:
- Пресинаптический. Это те заболевания, которые возникают вследствие нарушения синтеза, транспорта или слияния синаптических пузырьков. Примером может служить энцефалопатия, вторичная по отношению к мутации STXBP1.

- Постсинаптический. Это те заболевания, которые связаны с дендритными рецепторами. Примером являются GRINпатии (рецептор глутамата, инотропный, NMDA, субъединица 1).
Внутриклеточные молекулярные пути.
Транспортопатия
Las транспортопатии Все эти заболевания происходят из-за неисправности мембранных транспортных белков, набора каналообразных структур, которые позволяют проходить через мембраны как за счет использования активный транспорт как он пассивный транспорт в пользу градиента, позволяющего и регулирующего вход и выход различных соединений в клетку и клеточные органеллы.

Мы также можем классифицировать их по транспортируемым веществам: унипортер (1 одно вещество) или котранспортер (симпортер, 2 вещества в одном направлении; антипортер, 2 вещества в противоположных направлениях).

Существует несколько ресурсов с информацией о мембранных переносчиках, например: сайт международного общества мембранных транспортных белковили веб-сайт Bioparadigms, где классификационная запись всех белков SLC обнаружены к настоящему времени и их функции, а также инициатива ТрансКюр, для исследования лечения.
Существует множество ресурсов по изучению метаболических заболеваний, наиболее полезным является Вадемекум метаболикум.
Веб-сайты биохимические пути, где доступна диаграмма со всеми соответствующими метаболическими путями, или веб-сайт КЕГГ (Киотская энциклопедия генов и геномов), где доступна табличная информация о метаболитах, ферментах и кодирующих генах, а также диаграммы всех метаболических путей или веб-сайт. HumanCyC, энциклопедия метаболизма и генов человека.
- Аминоацидопатии и пептидные болезни.
- Заболевания углеводного обмена.
- Заболевания обмена жирных кислот, карнитина и кетоновых тел.
- Липидопатия.
- Пурины, пиримидины и нуклеотиды.
- Энергетический обмен.
- Нарушения гликозилирования.
- Метаболизм нейромедиаторов.
- Метаболизм витаминов и кофакторов.
- Обмен микроэлементов и металлов.
Микроуровень.

Цилиопатии.


Цитоскелет
Тубулинопатии
Гольгиопатии

Митохондриальные заболевания
Макроуровень.
Макроскопический фенотип. Нейроанатомия.
https://www.clinicalneuroanatomyseminars.com
http://braininfo.rprc.washington.edu/Default.aspx
http://www.atlasbrain.com/enx/atlas_main.html
Иерархия управления двигательной системой.
- Полиоэнцефалопатии.
- Лейкоэнцефалопатии.
- Заболевания базальных ганглиев.
- Церебеллопатии.
- Миелопатии.
- Нервно-мышечные заболевания.
- Полинейропатии.
- Миопатии.
- Заболевания нервно-мышечного соединения.
Онтогенетический (морфологический) фенотип.
Неврологический функциональный фенотип. Нейронаука.
Поведенческие фенотипы
Когнитивные эндофенотипы
Надиндивидуальные последствия.
Помимо индивидуума, различные уровни межиндивидуальной организации также могут представлять клинический интерес.
- Семья.
- Общество.
- Культура.






